生物有机肥和生物菌剂同属于微生物肥的范畴，不过他们的侧重点不一样，咱们来看一下：国家标准规定的微生物菌肥分以下3种：

一、微生物菌剂，执行标准：GB20287-2006，主要技术指标就是菌的含量，从2亿/克到几百亿不等，对有机质和氮磷钾没有要求。

二、生物有机肥，执行标准：NY884-2012，主要技术指标：菌0.2亿以上，有机质40%以上，对氮磷钾没有要求。

三、复合微生物肥料，执行标准：NY/T798-2004，主要技术指标：菌0.2亿以上，有机质20%以上，氮磷钾6%以上。

从国家标准可以看出：生物有机肥侧重的是有机质，通俗来说就是含菌的有机肥，在有机肥里面添加有益菌而已，最终中决定效果的主要还是有机质，如果菌的含量高还好一些，如果只有0.2亿/克，那还是当做有机肥来用吧：要知道：每克肥沃的土壤最少含有25亿个细菌、40万个真菌、还有藻类和原生动物，0.2亿施入土壤，杯水车薪。

而生物菌剂的直接指标就是菌的含量，菌的含量从几亿到几百亿不等，有利于增加土壤有益菌的种群优势，这只是其一；其二，生物菌是咱们肉眼看不到的，我们看到的其实是菌的载体，而生产厂家选择菌的载体多会选择黄腐酸钾、氨基酸、腐植酸，或者直接选择有机肥作为载体，既保障了有益菌的活性，又增加了土壤有机质的含量：其三：有机肥施入土壤，是不能直接吸收的，需要大量的有益菌分解成小分子有机物才能吸收，分解过程中并大量的植物内源激素，刺激植物生长。

从实际有益菌的数量和活性以及实际应用效果来看，微生物菌剂要比生物有机肥效果更好，不过大量的有益菌的投入也需要大量有机肥的投入，二者相辅相成，互相依存，如果微生物菌剂含有机质很少，还要大量投入有机肥的，选择一款有机质含量高的生物菌剂还是比较合理的。