有机肥生产过程中的废弃物处理方式主要有以下几种：

1. 分类和收集：首先，对有机废弃物进行分类和收集。在农村和城市设立分类垃圾桶，将厨余垃圾、农作物秸秆等有机废弃物与其他垃圾分开收集。此外，可以鼓励农民将畜禽粪便进行集中收集，确保有机废弃物的来源充足。
2. 预处理：为了提高有机废弃物的利用效率，可以对其进行预处理。例如，将农作物秸秆进行切碎，加速其分解过程；对厨余垃圾进行压榨，减少水分含量。预处理后的废弃物更易于后续处理和利用。
3. 肥料包装废弃物的回收处理：对于具有再利用价值的肥料包装废弃物，可以发挥市场作用，建立使用者收集、市场主体回收、企业循环利用的回收机制。对于无再利用价值的肥料包装废弃物，由使用者定期归集并交回村庄垃圾收集房（点、站），实行定点堆放、分类回收。有条件的地方，可将无再利用价值的肥料包装废弃物纳入农药包装废弃物回收处理体系。
4. 源头减量：鼓励肥料生产企业使用易资源化利用、易处置的包装物，探索使用水溶性高分子等可降解的包装物，逐步淘汰铝箔包装物，减少对环境的影响。鼓励化肥、有机肥生产企业使用便于回收的大容量包装物，水溶肥等液态肥生产企业尽量使用可回收二次利用包装物，从源头上减少肥料包装废弃物的产生。

以上信息仅供参考，可以根据当地具体情况选择合适的处理方式。